Protein–RNA interactions for Protein: Q04599

MRPL1, 54S ribosomal protein L1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 285 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL1	Q04599	NPT1	YOR209C	1290 nt		5.43	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	MRPS16	YPL013C	366 nt		5.43	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	DAP1	YPL170W	459 nt		5.43	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	snR34	snR34	203 nt		5.43	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	VAN1	YML115C	1608 nt		5.43	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	SKN1	YGR143W	2316 nt		5.43	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	ICL1	YER065C	1674 nt		5.43	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	EFT2	YDR385W	2529 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	EFT1	YOR133W	2529 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	PGK1	YCR012W	1251 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	YCR099C	YCR099C	468 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	IPK1	YDR315C	846 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	CTR2	YHR175W	570 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	ZRT2	YLR130C	1269 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	MRPS12	YNR036C	462 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	RPS28A	YOR167C	204 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	YPR123C	YPR123C	435 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	AVT4	YNL101W	2142 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	MDM31	YHR194W	1740 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	YHL017W	YHL017W	1599 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	PYC2	YBR218C	3543 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	SAC6	YDR129C	1929 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	YDR034W-B	YDR034W-B	156 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	COX20	YDR231C	618 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	YEL068C	YEL068C	333 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	RHO3	YIL118W	696 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	MAD2	YJL030W	591 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	ICT1	YLR099C	1185 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	YNL285W	YNL285W	372 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	ALG5	YPL227C	1005 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	HAL1	YPR005C	885 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	IFA38	YBR159W	1044 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	DIT1	YDR403W	1611 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	PFK2	YMR205C	2880 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	KKQ8	YKL168C	2175 nt		5.4	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	MOG1	YJR074W	657 nt		5.4	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	YML083C	YML083C	1257 nt		5.4	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	YNL200C	YNL200C	741 nt		5.4	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	ENV9	YOR246C	993 nt		5.4	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	YPR114W	YPR114W	948 nt		5.4	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	FES1	YBR101C	873 nt		5.4	□□□□□ -1.54
MRPL1	Q04599	COX9	YDL067C	180 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	PEX7	YDR142C	1128 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	YDR509W	YDR509W	348 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	DOT5	YIL010W	648 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	MRS1	YIR021W	1092 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	EFM3	YJR129C	1020 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	YKR075C	YKR075C	924 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	JNM1	YMR294W	1122 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	MNN5	YJL186W	1761 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	VMA13	YPR036W	1437 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	EDC1	YGL222C	528 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	tR(ACG)D	tR(ACG)D	73 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	tR(ACG)E	tR(ACG)E	73 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	tR(ACG)K	tR(ACG)K	73 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	tR(ACG)L	tR(ACG)L	73 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	tR(ACG)O	tR(ACG)O	73 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	RPS5	YJR123W	678 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	ADD66	YKL206C	804 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	POS5	YPL188W	1245 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	MCM3	YEL032W	2916 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	PDR18	YNR070W	4002 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	NUD1	YOR373W	2556 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	FHL1	YPR104C	2811 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	tR(UCU)Q1	tR(UCU)Q1	73 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	TIF34	YMR146C	1044 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	PDR16	YNL231C	1056 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	ATG4	YNL223W	1485 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	RPS16B	YDL083C	432 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	PPM1	YDR435C	987 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	MSA2	YKR077W	1092 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	YLR036C	YLR036C	612 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	YLR311C	YLR311C	348 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	YMR030W-A	YMR030W-A	291 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	CIN4	YMR138W	576 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	SUE1	YPR151C	621 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	YMD8	YML038C	1329 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	PRP24	YMR268C	1335 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	FRS2	YFL022C	1512 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	VHT1	YGR065C	1782 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	MPP10	YJR002W	1782 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	ALT1	YLR089C	1779 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	TUL1	YKL034W	2277 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	QNS1	YHR074W	2145 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	HOF1	YMR032W	2010 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	CEF1	YMR213W	1773 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	VBA1	YMR088C	1689 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	CNE1	YAL058W	1509 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	GPI18	YBR004C	1302 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	GCV3	YAL044C	513 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	YNL042W-B	YNL042W-B	258 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	ACS1	YAL054C	2142 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	PRP40	YKL012W	1752 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	RCK1	YGL158W	1539 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	RAP1	YNL216W	2484 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	YCR006C	YCR006C	474 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	PHB1	YGR132C	864 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	YHR095W	YHR095W	495 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	REX3	YLR107W	1215 nt		5.34	□□□□□ -1.55
MRPL1	Q04599	YNL194C	YNL194C	906 nt		5.34	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.5 ms