Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CDK17Q00537 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDK17Q00537 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDK17Q00537 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms