Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC1A4P43007 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC1A4P43007 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SLC1A4P43007 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC1A4P43007 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC1A4P43007 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC1A4P43007 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC1A4P43007 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC1A4P43007 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC1A4P43007 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC1A4P43007 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC1A4P43007 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC1A4P43007 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC1A4P43007 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC1A4P43007 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC1A4P43007 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC1A4P43007 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC1A4P43007 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC1A4P43007 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC1A4P43007 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC1A4P43007 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC1A4P43007 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms