Protein–RNA interactions for Protein: P39981

AVT2, Vacuolar amino acid transporter 2, yeastyeast

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT2P39981 SSK1YLR006C 2139 nt5.71□□□□□ -1.5
AVT2P39981 YGR127WYGR127W 939 nt5.7□□□□□ -1.5
AVT2P39981 RPS15YOL040C 429 nt5.7□□□□□ -1.5
AVT2P39981 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.7□□□□□ -1.5
AVT2P39981 ADE13YLR359W 1449 nt5.7□□□□□ -1.5
AVT2P39981 NUD1YOR373W 2556 nt5.7□□□□□ -1.5
AVT2P39981 YMR155WYMR155W 1644 nt5.7□□□□□ -1.5
AVT2P39981 LDB18YLL049W 540 nt5.69□□□□□ -1.5
AVT2P39981 SEC13YLR208W 894 nt5.69□□□□□ -1.5
AVT2P39981 YNR048WYNR048W 1182 nt5.69□□□□□ -1.5
AVT2P39981 BZZ1YHR114W 1902 nt5.68□□□□□ -1.5
AVT2P39981 CHO1YER026C 831 nt5.68□□□□□ -1.5
AVT2P39981 YKL151CYKL151C 1014 nt5.68□□□□□ -1.5
AVT2P39981 YLR317WYLR317W 435 nt5.68□□□□□ -1.5
AVT2P39981 RPT1YKL145W 1404 nt5.67□□□□□ -1.5
AVT2P39981 UTP7YER082C 1665 nt5.67□□□□□ -1.5
AVT2P39981 HSF1YGL073W 2502 nt5.67□□□□□ -1.5
AVT2P39981 YGR182CYGR182C 354 nt5.67□□□□□ -1.5
AVT2P39981 YLL059CYLL059C 507 nt5.67□□□□□ -1.5
AVT2P39981 YCL041CYCL041C 495 nt5.67□□□□□ -1.5
AVT2P39981 ENT2YLR206W 1842 nt5.67□□□□□ -1.5
AVT2P39981 SFB3YHR098C 2790 nt5.66□□□□□ -1.5
AVT2P39981 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.66□□□□□ -1.5
AVT2P39981 GPT2YKR067W 2232 nt5.66□□□□□ -1.5
AVT2P39981 BAP2YBR068C 1830 nt5.65□□□□□ -1.5
AVT2P39981 RPT6YGL048C 1218 nt5.65□□□□□ -1.5
AVT2P39981 ERG3YLR056W 1098 nt5.65□□□□□ -1.5
AVT2P39981 PNP1YLR209C 936 nt5.65□□□□□ -1.5
AVT2P39981 ERI1YPL096C-A 207 nt5.65□□□□□ -1.5
AVT2P39981 EPS1YIL005W 2106 nt5.65□□□□□ -1.51
AVT2P39981 DAL4YIR028W 1908 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT2P39981 RET1YOR207C 3450 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT2P39981 SLO1YER180C-A 258 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT2P39981 PRM10YJL108C 1152 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT2P39981 PFA3YNL326C 1011 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT2P39981 GAA1YLR088W 1845 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT2P39981 VPS70YJR126C 2436 nt5.64□□□□□ -1.51
AVT2P39981 TNA1YGR260W 1605 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT2P39981 PRO3YER023W 861 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT2P39981 THI4YGR144W 981 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT2P39981 MTQ1YNL063W 945 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT2P39981 HSP26YBR072W 645 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT2P39981 UBC4YBR082C 447 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT2P39981 NOB1YOR056C 1380 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT2P39981 TEF1YPR080W 1377 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT2P39981 TEF2YBR118W 1377 nt5.63□□□□□ -1.51
AVT2P39981 YFL034WYFL034W 3222 nt5.62□□□□□ -1.51
AVT2P39981 YOR318CYOR318C 306 nt5.62□□□□□ -1.51
AVT2P39981 CBC2YPL178W 627 nt5.62□□□□□ -1.51
AVT2P39981 YHR045WYHR045W 1683 nt5.62□□□□□ -1.51
AVT2P39981 MHR1YDR296W 681 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT2P39981 DED81YHR019C 1665 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT2P39981 YJR015WYJR015W 1533 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT2P39981 ALT1YLR089C 1779 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT2P39981 UBP13YBL067C 2244 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT2P39981 CBK1YNL161W 2271 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT2P39981 SOG2YOR353C 2376 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT2P39981 YPL062WYPL062W 405 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT2P39981 SSO1YPL232W 873 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT2P39981 KTR3YBR205W 1215 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT2P39981 YGL036WYGL036W 2730 nt5.61□□□□□ -1.51
AVT2P39981 GEX1YCL073C 1848 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT2P39981 GEX2YKR106W 1848 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT2P39981 MMP1YLL061W 1752 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT2P39981 GEP3YOR205C 1671 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT2P39981 TBF1YPL128C 1689 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT2P39981 SEC12YNR026C 1416 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT2P39981 IPI1YHR085W 1005 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT2P39981 SFC1YJR095W 969 nt5.6□□□□□ -1.51
AVT2P39981 SAM4YPL273W 978 nt5.59□□□□□ -1.51
AVT2P39981 YPR195CYPR195C 330 nt5.59□□□□□ -1.51
AVT2P39981 GSY2YLR258W 2118 nt5.59□□□□□ -1.52
AVT2P39981 TOS4YLR183C 1470 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT2P39981 MCM6YGL201C 3054 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT2P39981 GET3YDL100C 1065 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT2P39981 YDR541CYDR541C 1035 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT2P39981 HXK2YGL253W 1461 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT2P39981 TAX4YJL083W 1815 nt5.58□□□□□ -1.52
AVT2P39981 MTQ2YDR140W 666 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT2P39981 SIP2YGL208W 1248 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT2P39981 TDH3YGR192C 999 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT2P39981 YHR127WYHR127W 732 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT2P39981 YLR283WYLR283W 945 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT2P39981 YBL044WYBL044W 369 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT2P39981 POR1YNL055C 852 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT2P39981 PSH1YOL054W 1221 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT2P39981 RRT2YBR246W 1164 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT2P39981 UTP18YJL069C 1785 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT2P39981 ASH1YKL185W 1767 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT2P39981 PHO8YDR481C 1701 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT2P39981 GPA1YHR005C 1419 nt5.57□□□□□ -1.52
AVT2P39981 ERP2YAL007C 648 nt5.56□□□□□ -1.52
AVT2P39981 HSP150YJL159W 1242 nt5.56□□□□□ -1.52
AVT2P39981 TRP5YGL026C 2124 nt5.56□□□□□ -1.52
AVT2P39981 SCT1YBL011W 2280 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT2P39981 RAT1YOR048C 3021 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT2P39981 HAL5YJL165C 2568 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT2P39981 RHO2YNL090W 579 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT2P39981 YPR098CYPR098C 486 nt5.55□□□□□ -1.52
AVT2P39981 NDC1YML031W 1968 nt5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms