Protein–RNA interactions for Protein: P33400

RIM101, pH-response transcription factor pacC/RIM101, yeastyeast

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM101P33400 ARO3YDR035W 1113 nt10.21□□□□□ -0.77
RIM101P33400 AHT1YHR093W 549 nt10.21□□□□□ -0.77
RIM101P33400 YJL114WYJL114W 681 nt10.21□□□□□ -0.77
RIM101P33400 TTI2YJR136C 1266 nt10.21□□□□□ -0.77
RIM101P33400 VMA5YKL080W 1179 nt10.21□□□□□ -0.77
RIM101P33400 AAD14YNL331C 1131 nt10.21□□□□□ -0.77
RIM101P33400 SPS2YDR522C 1509 nt10.2□□□□□ -0.78
RIM101P33400 MRPL4YLR439W 960 nt10.2□□□□□ -0.78
RIM101P33400 RIB7YBR153W 735 nt10.2□□□□□ -0.78
RIM101P33400 RAD7YJR052W 1698 nt10.19□□□□□ -0.78
RIM101P33400 SHU2YDR078C 672 nt10.19□□□□□ -0.78
RIM101P33400 TDA10YGR205W 873 nt10.19□□□□□ -0.78
RIM101P33400 PRS3YHL011C 963 nt10.19□□□□□ -0.78
RIM101P33400 HOT13YKL084W 351 nt10.19□□□□□ -0.78
RIM101P33400 YOR263CYOR263C 408 nt10.19□□□□□ -0.78
RIM101P33400 DEF1YKL054C 2217 nt10.19□□□□□ -0.78
RIM101P33400 PRD1YCL057W 2139 nt10.19□□□□□ -0.78
RIM101P33400 IES1YFL013C 2079 nt10.19□□□□□ -0.78
RIM101P33400 MSS116YDR194C 1995 nt10.19□□□□□ -0.78
RIM101P33400 VPS36YLR417W 1701 nt10.19□□□□□ -0.78
RIM101P33400 BPL1YDL141W 2073 nt10.18□□□□□ -0.78
RIM101P33400 TYR1YBR166C 1359 nt10.18□□□□□ -0.78
RIM101P33400 YJL007CYJL007C 315 nt10.18□□□□□ -0.78
RIM101P33400 POP8YBL018C 402 nt10.18□□□□□ -0.78
RIM101P33400 LSR1LSR1 1175 nt10.18□□□□□ -0.78
RIM101P33400 CCS1YMR038C 750 nt10.18□□□□□ -0.78
RIM101P33400 OPI10YOL032W 741 nt10.18□□□□□ -0.78
RIM101P33400 YOR114WYOR114W 885 nt10.18□□□□□ -0.78
RIM101P33400 YCL002CYCL002C 792 nt10.18□□□□□ -0.78
RIM101P33400 COS7YDL248W 1152 nt10.17□□□□□ -0.78
RIM101P33400 RPL4BYDR012W 1089 nt10.17□□□□□ -0.78
RIM101P33400 RAD55YDR076W 1221 nt10.17□□□□□ -0.78
RIM101P33400 YFL066CYFL066C 1179 nt10.17□□□□□ -0.78
RIM101P33400 COS5YJR161C 1152 nt10.17□□□□□ -0.78
RIM101P33400 TRI1YMR233W 681 nt10.17□□□□□ -0.78
RIM101P33400 YSY6YBR162W-A 198 nt10.17□□□□□ -0.78
RIM101P33400 GRH1YDR517W 1119 nt10.16□□□□□ -0.78
RIM101P33400 YER181CYER181C 324 nt10.16□□□□□ -0.78
RIM101P33400 YIL089WYIL089W 618 nt10.16□□□□□ -0.78
RIM101P33400 YJL218WYJL218W 591 nt10.16□□□□□ -0.78
RIM101P33400 MTW1YAL034W-A 870 nt10.16□□□□□ -0.78
RIM101P33400 SPR2YOR214C 711 nt10.16□□□□□ -0.78
RIM101P33400 ETR1YBR026C 1143 nt10.16□□□□□ -0.78
RIM101P33400 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt10.16□□□□□ -0.78
RIM101P33400 ICS2YBR157C 768 nt10.16□□□□□ -0.78
RIM101P33400 CTI6YPL181W 1521 nt10.16□□□□□ -0.78
RIM101P33400 HOG1YLR113W 1308 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM101P33400 YDR366CYDR366C 399 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM101P33400 YER006C-AYER006C-A 318 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM101P33400 CAK1YFL029C 1107 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM101P33400 AQY2YLL052C 450 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM101P33400 NAT4YMR069W 858 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM101P33400 GPI12YMR281W 915 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM101P33400 GET4YOR164C 939 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM101P33400 GRX1YCL035C 333 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM101P33400 HXT7YDR342C 1713 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM101P33400 HXT6YDR343C 1713 nt10.15□□□□□ -0.78
RIM101P33400 URA8YJR103W 1737 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YGL159WYGL159W 1113 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM101P33400 BUD19YJL188C 309 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YJU3YKL094W 942 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM101P33400 GCD7YLR291C 1146 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YBL029WYBL029W 1131 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM101P33400 RAS2YNL098C 969 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM101P33400 VPS21YOR089C 633 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM101P33400 TUM1YOR251C 915 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YMR265CYMR265C 1386 nt10.14□□□□□ -0.79
RIM101P33400 DON1YDR273W 1098 nt10.13□□□□□ -0.79
RIM101P33400 RML2YEL050C 1182 nt10.13□□□□□ -0.79
RIM101P33400 BGL2YGR282C 942 nt10.13□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt10.13□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YLR339CYLR339C 552 nt10.13□□□□□ -0.79
RIM101P33400 GPN2YOR262W 1044 nt10.13□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YCL049CYCL049C 939 nt10.13□□□□□ -0.79
RIM101P33400 FEN2YCR028C 1539 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 TRP3YKL211C 1455 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 ARG82YDR173C 1068 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 MOB2YFL034C-B 864 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 SCM4YGR049W 564 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YGR201CYGR201C 678 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YMR166CYMR166C 1107 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 RPS10BYMR230W 318 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YNL203CYNL203C 612 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 ATP23YNR020C 813 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 MVD1YNR043W 1191 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 UFE1YOR075W 1041 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 MRPL40YPL173W 894 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 YEH1YLL012W 1722 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 MGA1YGR249W 1371 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 VPS30YPL120W 1674 nt10.12□□□□□ -0.79
RIM101P33400 ALD4YOR374W 1560 nt10.11□□□□□ -0.79
RIM101P33400 MRPL35YDR322W 1104 nt10.11□□□□□ -0.79
RIM101P33400 DDI2YFL061W 678 nt10.11□□□□□ -0.79
RIM101P33400 NMA1YLR328W 1206 nt10.11□□□□□ -0.79
RIM101P33400 DDI3YNL335W 678 nt10.11□□□□□ -0.79
RIM101P33400 RER2YBR002C 861 nt10.11□□□□□ -0.79
RIM101P33400 WSC4YHL028W 1818 nt10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms