Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NR4A1P22736 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms