Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BMP4P12644 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP4P12644 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP4P12644 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP4P12644 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP4P12644 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP4P12644 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP4P12644 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP4P12644 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BMP4P12644 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP4P12644 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP4P12644 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP4P12644 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP4P12644 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP4P12644 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP4P12644 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP4P12644 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP4P12644 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BMP4P12644 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP4P12644 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP4P12644 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BMP4P12644 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP4P12644 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP4P12644 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP4P12644 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP4P12644 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP4P12644 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP4P12644 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP4P12644 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP4P12644 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP4P12644 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BMP4P12644 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP4P12644 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP4P12644 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP4P12644 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BMP4P12644 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMP4P12644 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BMP4P12644 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
BMP4P12644 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP4P12644 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP4P12644 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP4P12644 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP4P12644 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP4P12644 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP4P12644 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP4P12644 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BMP4P12644 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP4P12644 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP4P12644 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP4P12644 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP4P12644 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP4P12644 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP4P12644 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP4P12644 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BMP4P12644 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP4P12644 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP4P12644 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP4P12644 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP4P12644 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP4P12644 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BMP4P12644 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP4P12644 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP4P12644 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP4P12644 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP4P12644 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP4P12644 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP4P12644 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP4P12644 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP4P12644 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP4P12644 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP4P12644 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BMP4P12644 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP4P12644 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP4P12644 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP4P12644 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP4P12644 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP4P12644 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP4P12644 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP4P12644 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BMP4P12644 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP4P12644 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP4P12644 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP4P12644 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP4P12644 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP4P12644 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP4P12644 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BMP4P12644 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP4P12644 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP4P12644 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP4P12644 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP4P12644 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP4P12644 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP4P12644 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP4P12644 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BMP4P12644 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BMP4P12644 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
BMP4P12644 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BMP4P12644 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP4P12644 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BMP4P12644 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms