Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RD3LP0DJH9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RD3LP0DJH9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RD3LP0DJH9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms