Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8BP07358 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8BP07358 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8BP07358 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8BP07358 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8BP07358 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8BP07358 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8BP07358 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8BP07358 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8BP07358 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8BP07358 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8BP07358 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8BP07358 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8BP07358 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8BP07358 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8BP07358 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8BP07358 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8BP07358 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8BP07358 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8BP07358 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8BP07358 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8BP07358 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8BP07358 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8BP07358 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8BP07358 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8BP07358 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8BP07358 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8BP07358 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C8BP07358 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8BP07358 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8BP07358 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8BP07358 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C8BP07358 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8BP07358 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8BP07358 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8BP07358 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8BP07358 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8BP07358 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8BP07358 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8BP07358 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8BP07358 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8BP07358 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8BP07358 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8BP07358 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8BP07358 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8BP07358 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C8BP07358 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8BP07358 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C8BP07358 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8BP07358 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8BP07358 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8BP07358 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8BP07358 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8BP07358 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8BP07358 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8BP07358 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8BP07358 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8BP07358 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8BP07358 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8BP07358 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8BP07358 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8BP07358 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C8BP07358 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C8BP07358 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8BP07358 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8BP07358 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8BP07358 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8BP07358 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8BP07358 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8BP07358 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8BP07358 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C8BP07358 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C8BP07358 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8BP07358 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8BP07358 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8BP07358 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C8BP07358 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8BP07358 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8BP07358 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8BP07358 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8BP07358 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8BP07358 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8BP07358 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C8BP07358 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C8BP07358 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms