Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01787 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01787 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01787 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01787 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01787 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01787 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
P01787 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01787 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01787 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01787 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01787 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01787 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01787 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01787 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01787 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01787 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01787 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01787 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01787 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01787 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01787 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01787 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01787 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01787 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01787 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01787 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01787 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01787 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01787 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01787 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01787 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01787 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01787 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01787 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01787 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01787 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01787 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01787 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01787 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01787 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01787 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01787 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01787 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01787 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01787 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01787 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01787 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01787 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01787 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01787 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01787 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01787 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01787 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01787 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01787 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01787 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01787 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01787 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01787 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01787 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01787 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01787 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01787 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01787 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01787 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01787 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01787 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01787 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01787 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01787 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01787 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01787 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01787 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01787 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01787 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01787 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01787 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01787 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01787 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01787 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01787 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01787 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01787 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01787 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01787 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms