Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28919A0A087WP35 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28919A0A087WP35 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm28919A0A087WP35 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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