Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KDM2AQ9Y2K7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms