Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPJQ9HC77 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms