Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNF17Q9BXT8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms