Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SALL3Q9BXA9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL3Q9BXA9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms