Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RUNDC1Q96C34 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms