Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKD1Q969G9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms