Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCE1Q969G3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMARCE1Q969G3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms