Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TTC21AQ8NDW8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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