Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP13Q86W25 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms