Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
WDR53Q7Z5U6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms