Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APTXQ7Z2E3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms