Protein–RNA interactions for Protein: Q7L804

RAB11FIP2, Rab11 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP2Q7L804 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RAB11FIP2Q7L804 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB11FIP2Q7L804 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB11FIP2Q7L804 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB11FIP2Q7L804 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RAB11FIP2Q7L804 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB11FIP2Q7L804 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB11FIP2Q7L804 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB11FIP2Q7L804 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB11FIP2Q7L804 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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