Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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MED27Q6P2C8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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MED27Q6P2C8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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MED27Q6P2C8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED27Q6P2C8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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