Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GDF6Q6KF10 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GDF6Q6KF10 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms