Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTXN3Q4LDR2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms