Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL24A1Q17RW2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL24A1Q17RW2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms