Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RBBP7Q16576 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms