Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN9AQ15858 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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