Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCM1Q15154 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms