Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
POLD3Q15054 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms