Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CDK6Q00534 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms