Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
RPS29P62273 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
RPS29P62273 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms