Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LOXL3P58215 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms