Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXC13P31276 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms