Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB3O43889 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB3O43889 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms