Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
DENRO43583 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DENRO43583 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DENRO43583 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DENRO43583 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DENRO43583 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DENRO43583 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DENRO43583 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
DENRO43583 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
DENRO43583 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
DENRO43583 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DENRO43583 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DENRO43583 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms