Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TO15178 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TO15178 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TO15178 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TO15178 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TO15178 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TO15178 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TO15178 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TO15178 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TO15178 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TO15178 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TO15178 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TO15178 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TO15178 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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