Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PATL2C9JE40 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms