Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOBPA7XYQ1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms