Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms