Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HMG20AQ9NP66 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms