Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FYCO1Q9BQS8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FYCO1Q9BQS8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms