Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3CQ99985 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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