Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC149Q6ZUS6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms