Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPP1Q16831 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms