Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATP2B3Q16720 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms