Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTCH1Q13635 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTCH1Q13635 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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