Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
PKD1P98161 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
PKD1P98161 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms