Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BACE1P56817 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BACE1P56817 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BACE1P56817 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms